Escarro: Coletar preferencialmente, a primeira amostra da manhã. Orientar o paciente a enxaguar previamente a boca com água, várias vezes, para remover a flora bacteriana superficial dessa região e colher a amostra obtida após tosse profunda, diretamente em frasco de boca larga com tampa de rosca.

Escarro induzido: A coleta deve ser feita em frasco estéril com tampa de rosca, após a realização de nebulização da boca com solução salina hipertônica a 3% durante no mínimo 5 e no máximo 20 minutos. Informar no frasco que o escarro foi coletado por esse método, porque seu aspecto é salivar.

Fezes:  Coletar no mínimo 1g em frasco estéril sem conservante ou diluentes.

Urina amostra isolada: Coletar em fraso apropriado preferencialmente a primeira urina da manhã ou com intervalo mínimo de 4 horas após a última miccção. Desprezar o primeiro jato de urina e sem interromper a miccção, coletar o jato médio.

Volume mínimo: 40mL.